Ir al contenido principal

ENFOQUE GENERAL SOBRE PARSIMONIA Y SUS DIFERENTES MÉTODOS

Paulin Polanco Fontalvo

La parsimonia es una estrategia de investigación ampliamente utilizada para analizar y explicar hipótesis desde un punto de vista más “sencillo”. Esta argumentación tiene bases históricas que van desde Copérnico, cuando sostuvo que la teoría heliocéntrica era superior a la geocéntrica dada su simplicidad, pasando por las de Darwin y Lamarck, hasta las investigaciones que se desarrollan hoy. Las ciencias biológicas no son ajenas en la aplicación de la parsimonia para explicar relaciones filogenéticas entre especies. Por esto, mediante la observación de parámetros tanto morfológicos como moleculares, diferentes autores han sugerido varios tipos de parsimonia de acuerdo a los tipos de caracteres evaluados.

La argumentación Hennigiana aplicada por Hennig (1966), es un método manual que considera la información suministrada por los caracteres para la construcción de un cladograma (en cada uno de los casos) que permita seleccionar el cladograma que presente el menor número de pasos, al momento de combinarlos. No obstante esta argumentación se basa en tres reglas que son; de agrupamiento, de inclusión/exclusión y de homoplasia. Por otro lado existen dos tipos de parsimonia que resultan similares entre sí, la primera propuesta por Wagner (1970) quien dice que todos los caracteres que tengan tres o más estados de carácter se consideran ordenados y cuando hay reversión de dos a cero, se considera como dos pasos. Mientras que el segundo tipo de parsimonia propuesto por Fitch (1971), considera que los caracteres con tres o más estados de carácter son carentes de orden y cuando existe reversión de cero a dos, se cuenta como un solo paso.

Como complemento, existe la “parsimonia general” propuesta por Swofford y Olsen (1990), permite hacer una mezcla en un solo análisis siguiendo una serie de parámetros generalizados, donde la parsimonia de Wagner se podría usar para analizar un set de caracteres y la de Fitch otro set de caracteres. No obstante,  existen dos formas alternativas y poco comunes de parsimonia propuestas por Camin y Sokal (1965), quienes sugieren que los estados de carácter no pueden sufrir una reversión de uno a cero, mientras que si puede sufrir evolución tantas veces sean posibles. Y Farris (1977) implementa la parsimonia de Dollo, la cual si admite un cambio único de cero a uno y tantos números de cambios reversibles de uno a cero como sean posibles, siempre y cuando permita explicar los datos.  

Sin embargo, métodos más novedosos se han desarrollado para implementar otro tipo de parsimonias desde se destacan la búsqueda exhaustiva; que consideran todos los cladogramas posibles, teniendo en cuenta que si alguno posee una rama no justificada, colapsa esa rama. La búsqueda Branch and bound, la cual examina sólo los cladogramas que puedan ser más cortos. Se destaca también la búsqueda por permutación de ramas, que corta y re-arregla las ramas para considerar la topología más corta y finalmente se considera la parsimonia de Matraca, que computa matrices muy grandes, pero la posibilidad de obtener una solución parsiomoniosa es menor. Teniendo en cuenta lo anterior, la selección del método más adecuado a la hora de analizar un set de datos, es muy importante para poder generar explicaciones puntuales sobre cómo han evolucionado las especies para estructurar y conformar lo que hoy conocemos como “vida”.

Referencias

Albert, V. (2005). Parsimony, Philogeny and Genomics. Universidad de Oslo. Oxford University Press. New York.

Morrone, J. (2013) Sistemática. Fundamentos, métodos y aplicaciones. Universidad Nacional Autónoma de México. 1ª edición.

Wiley y Lieberman (2011). Phylogenetics. Theory and practice of Phylogenetic Sistematics. Editorial John Wiley & Sons, Inc. New Jersey. 2ª edición.




Comentarios

Entradas más populares de este blog

Reconstrucción Filogenética a Partir de Máxima Verosimilitud

Leidy Pico Martínez Para los análisis de reconstrucción filogenética, encontrados dos métodos principales, los primeros utilizan distancias genéticas, como Neighbor-Joining (NJ) y Mínima Evolución, y los basados en caracteres, como es el caso de Máxima Parsimonia (MP), Máxima Verosimilitud (ML por sus siglas en inglés “Máximum Likelihood) e inferencia Bayesiana (IB). En los métodos basados en caracteres, ML y IB, se caracterizan por ser métodos probabilísticos y a diferencia de MP, tratan la inferencia filogenética como un problema estadístico, en el cual, se utilizan modelos de evolución molecular para llevar a cabo el cálculo de probabilidades ( Swofford et al 1996). El principio de Máxima Verosimilitud ha sido utilizando con mayor frecuencia por los biólogos sistemáticos para inferir filogenias. Este método fue desarrollado por Ronald Fisher y es definido como La probabilidad de la observación de datos cuando un parámetro es dado (Queiroz & Poe 2001). ¿en qué consisten ...

Parsimonia: ¿Qué es?, Ventajas y desventajas

Viviana Lizeth Ayus Ortiz Dentro de los métodos que se han propuesto para inferir filogenias está el método de Parsimonia. Éste se basa en encontrar la filogenia en la cual los caracteres observados representen el menor cambio evolutivo. Es decir encontrar la hipótesis filogenética más parsimoniosa, más simple dado el número de transformaciones de los caracteres. Pero cómo se miden los cambios evolutivos bajo este método? Lo anterior depende del tipo de parsimonia y el tipo de datos. De acuerdo a lo anterior podemos describir tres tipos principales de parsimonia. Camin-Sokal parsimony (1965) en donde los caracteres usados son discretos y se permiten múltiples estados. Bajo este método se busca minimizar el número de cambios extra. Wagner parsimony (1969) acepta recodificación de caracteres multiestados arrojando una topología sin enraizar y asumiendo que de conocerse el ancestro este debería ser la raiz de la topología. Bajo éste método, que es en el cual se obtiene el menor n...